גורמים חשובים במערכת החיסון המנקזים ומסננים את נוזל הלימפה המכיל תאי דם לבנים וגורמים של מערכת החיסון על מנת למנוע חדירה של גופים זרים כגון חיידקים ונגיפים אל מחזור הדם.
קשרי הלימפה מרוכזים באשכולות בבסיסי האברים בגוף לאורך מערכת הלימפה, לרבות בצדי הצוואר, בעורף, בבית השחי, במפשעה, בחלל החזה ובבטן.
כאשר מתפתחת תגובה חיסונית מתנפחים קשרי הלימפה עקב הצטברות תאי דם לבנים. נפיחות בקשרי הלימפה אופיינית למספר מחלות זיהומיות דוגמת אדמת, חצבת ומונונוקלאוזיס (מחלת הנשיקה). מערכת הלימפה משמשת גם כנתיב מרכזי להתפשטות גרורות סרטניות.